問：總公司適用稅率與分公司適用稅率不一致的情況下，如何確定總分支機(jī)構(gòu)應(yīng)預(yù)繳的企業(yè)所得稅？

答：《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法〉的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2012年第57號(hào)）第十八條規(guī)定：“對(duì)于按照稅收法律、法規(guī)和其他規(guī)定，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算全部應(yīng)納稅所得額，然后按本辦法第六條規(guī)定的比例和按第十五條計(jì)算的分?jǐn)偙壤?jì)算劃分不同稅率地區(qū)機(jī)構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計(jì)算應(yīng)納稅額后加總計(jì)算出匯總納稅企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額，最后按本辦法第六條規(guī)定的比例和按第十五條計(jì)算的分?jǐn)偙壤蚩倷C(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偩偷乩U納的企業(yè)所得稅款。” 即首先對(duì)全部應(yīng)納稅所得額進(jìn)行分配，以得出企業(yè)應(yīng)納稅總額；然后對(duì)應(yīng)納稅總額進(jìn)行分配，以確定各分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅額。

舉例：甲公司設(shè)有A、B、C三個(gè)分支機(jī)構(gòu)，其中A在西部地區(qū)從事國(guó)家鼓勵(lì)產(chǎn)業(yè)享受15%的稅率，甲公司和B、C都是25%的稅率。2015年第一季度，三個(gè)分支機(jī)構(gòu)應(yīng)納稅所得額分別為500萬元、300萬元、200萬元。根據(jù)跨地區(qū)經(jīng)營(yíng)匯總納稅企業(yè)所得稅管理規(guī)定：總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算的當(dāng)期實(shí)際應(yīng)納所得稅額，50%由總機(jī)構(gòu)預(yù)繳，50%在各分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)傤A(yù)繳，各分支機(jī)構(gòu)再依據(jù)經(jīng)營(yíng)收入、職工工資和資產(chǎn)總額三個(gè)因素及相應(yīng)權(quán)重，計(jì)算分?jǐn)偙壤?。A、B、C三個(gè)分支機(jī)構(gòu)按規(guī)定計(jì)算出的分?jǐn)偙壤謩e為20%、30%、50%。總分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳所得稅額計(jì)算方法如下：

1.總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算全部應(yīng)納稅所得額為1000（500+300+200）萬元。

2.計(jì)算劃分總分支機(jī)構(gòu)應(yīng)納稅所得額：

　?。?）總機(jī)構(gòu)500萬元（1000×50%）；

　?。?）A機(jī)構(gòu)100萬元（1000×50%×20%）；

　?。?）B機(jī)構(gòu)150萬元（1000×50%×30%）；

　?。?）C機(jī)構(gòu)250萬元（1000×50%×50%）。

　　3.按總機(jī)構(gòu)和各分支機(jī)構(gòu)所在地適用稅率計(jì)算應(yīng)納稅額：

　?。?）總機(jī)構(gòu)125萬元（500×25%）；

　　（2）A機(jī)構(gòu)15萬元（100×15%）；

　　（3）B機(jī)構(gòu)37.5萬元（150×25%）；

　　（4）C機(jī)構(gòu)62.5萬元（250×25%）。

　 4.確定總分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳所得稅額。甲公司2015年一季度應(yīng)預(yù)繳所得稅總額為240萬元，然后對(duì)應(yīng)納稅總額進(jìn)行分配，以確定甲公司2015年一季度總分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳所得稅額：

　?。?）總機(jī)構(gòu)：240×50%＝120（萬元）；

　?。?）A機(jī)構(gòu)：240×50%×20%＝24（萬元）；

　　（3）B機(jī)構(gòu)：240×50%×30%＝36（萬元）；

（4）C機(jī)構(gòu)：240×50%×50%＝60（萬元）。

這種分?jǐn)偡椒ㄖ饕康氖欠乐蛊髽I(yè)將利潤(rùn)由高稅率地區(qū)向低稅率地區(qū)轉(zhuǎn)移，同時(shí)也有利于均衡各地稅收利益。